En 1974 se crea la Vicerrectoría de Investigación y Asistencia Técnica, dividida en la Dirección de Investigación Científicas y Tecnológicas (que dará origen a la DGIP) y la Dirección de Servicios y Asistencia Técnica. La primera, destinada a impulsar la investigación dentro de la Universidad; y la segunda, a coordinar las prácticas y proyectos de ésta.

Después de 11 años, ya en 1985 fue creada la Dirección General de Investigación y Postgrado (DGIP), a partir de la existencia de dos unidades precursoras: la Escuela de Graduados, existente desde 1960, y la Dirección General de Desarrollo Científico y Tecnológico.

El año 2000 se crea el CBDAL "Centro de Biotecnología Dr. Daniel Alkalay Lowitt" (CB-DAL), como unidad dependiente de la Vicerrectoría Académica a través de la Dirección General de Investigación y Postgrado, responsable de impulsar la investigación y el desarrollo en biotecnología.

En 2001 se crea el Instituto Internacional para la Innovación Empresarial (3IE), para impulsar el desarrollo productivo del país mediante el emprendimiento, la innovación y la creación de nuevas empresas orientadas al mercado global, transformándose en una entidad articuladora de los distintos actores que se desempeñan en los ámbitos económicos y de nuevas tecnologías, a través de sus unidades y centros de competencias especificas.

El incremento de la Investigación Científica y de Alumnos/as de pre y postgrado, ha ido acompañado de una fuerte inversión en infraestructura para satisfacer las nuevas necesidades, manteniendo incólume el sello de calidad y prestigio de la Institución. En este contexto, en 2008 se inaugura el Edificio de Innovación Tecnológica, que alberga a los centros dedicados a la investigación aplicada, con la clara tarea de generar valor y reforzar vínculos con el sector productivo.

El Centro Científico Tecnológico de Valparaíso (CCTVal) tiene sus inicios el año 2009, tras la adjudicación del Programa de Financiamiento Basal para Centros Científicos y Tecnológicos de Excelencia brindado por la Comisión Nacional de Investigación Científica y Tecnológica (CONICYT), que acredita la trayectoria con la que cuenta la Universidad Santa María y los/as profesionales de las áreas científicas que componen el centro.

El Centro Avanzado de Ingeniería Eléctrica y Electrónica, AC3E, nace el año 2014 con la adjudicación del Tercer Concurso Nacional de Financiamiento Basal del Programa de Investigación Asociativa, PIA, de la Comisión Nacional de Investigación Científica y Tecnológica, Conicyt.

El año 2015 se modificó la anterior Dirección General de Investigación y Postgrado, incorporando la innovación dentro del quehacer de la Dirección cambiando su nombre a Dirección General de Investigación, Innovación y Postgrado (DGIIP) que integra a la Investigación, docencia de postgrado, a la Innovación y a proyectos como la Oficina de Transferencia Tecnológica y Licenciamiento (OTTL), además de hacerse cargo de Centros de I+D+i tales como el AC3E (2014), CCTVal (2009) y CETAM (2008).

Por Decreto de Rectoría N°151/2019, de fecha 11 de Marzo de 2019, que promulgó modificaciones al Reglamento Orgánico de la Administración Superior y se crea a partir de lo anterior nuestra actual Dirección General de Investigación, y Emprendimiento (DGIIE) la que se instalará a fines de 2019 en el Edificio de Innovación Tecnológica I, unidades que prestarán servicios a los académicos investigadores, centros, emprendedores, entre otros.